5B2P | pdb_00005b2p

Crystal structure of Francisella novicida Cas9 in complex with sgRNA and target DNA (TGA PAM)

WebGL does not seem to be available.

This can be caused by an outdated browser, graphics card driver issue, or bad weather. Sometimes, just restarting the browser helps. Also, make sure hardware acceleration is enabled in your browser.

For a list of supported browsers, refer to http://caniuse.com/#feat=webgl.

Welcome
RCSB PDB Mol* Viewer 2.11.2 [1/27/2025, 4:56:27 PM]
Sequence of
     ​G​​S​​H​​M​​N​​F​​K​​I​​L​​P​8    ​I​​A​​I​​D​​L​​G​​V​​K​​N​​T​18   ​G​​V​​F​​S​​A​​F​​Y​​Q​​K​​G​28   ​T​​S​​L​​E​​R​​L​​D​​N​​K​​N​38   ​G​​K​​V​​Y​​E​​L​​S​​K​​D​​S​48   ​Y​​T​​L​​L​​M​​N​​N​​R​​T​​A​58   ​R​​R​​H​​Q​​R​​R​​G​​I​​D​​R​68   ​K​​Q​​L​​V​​K​​R​​L​​F​​K​​L​78   ​I​​W​​T​​E​​Q​​L​​N​​L​​E​​W​88   ​D​​K​​D​​T​​Q​​Q​​A​​I​​S​​F​98   ​L​​F​​N​​R​​R​​G​​F​​S​​F​​I​108  ​T​​D​​G​​Y​​S​​P​​E​​Y​​L​​N​     ​I​​V​​P​​E​​Q​​V​​K​​A​​I​​L​128  ​M​​D​​I​​F​​D​​D​​Y​​N​​G​​E​138  ​D​​D​​L​​D​​S​​Y​​L​​K​​L​​A​148  ​T​​E​​Q​​E​​S​​K​​I​​S​​E​​I​158  ​Y​​N​​K​​L​​M​​Q​​K​​I​​L​​E​168  ​F​​K​​L​​M​​K​​L​​C​​T​​D​​I​178  ​K​​D​​D​​K​​V​​S​​T​​K​​T​​L​188  ​K​​E​​I​​T​​S​​Y​​E​​F​​E​​L​198  ​L​​A​​D​​Y​​L​​A​​N​​Y​​S​​E​208  ​S​​L​​K​​T​​Q​​K​​F​​S​​Y​​T​     ​D​​K​​Q​​G​​N​​L​​K​​E​​L​​S​     ​Y​​Y​​H​​H​​D​​K​​Y​​N​​I​​Q​238  ​E​​F​​L​​K​​R​​H​​A​​T​​I​​N​248  ​D​​R​​I​​L​​D​​T​​L​​L​​T​​D​258  ​D​​L​​D​​I​​W​​N​​F​​N​​F​​E​     ​K​​F​​D​​F​​D​​K​​N​​E​​E​​K​     ​L​​Q​​N​​Q​​E​​D​​K​​D​​H​​I​     ​Q​​A​​H​​L​​H​​H​​F​​V​​F​​A​298  ​V​​N​​K​​I​​K​​S​​E​​M​​A​​S​308  ​G​​G​​R​​H​​R​​S​​Q​​Y​​F​​Q​318  ​E​​I​​T​​N​​V​​L​​D​​E​​N​​N​328  ​H​​Q​​E​​G​​Y​​L​​K​​N​​F​​C​338  ​E​​N​​L​​H​​N​​K​​K​​Y​​S​​N​348  ​L​​S​​V​​K​​N​​L​​V​​N​​L​​I​358  ​G​​N​​L​​S​​N​​L​​E​​L​​K​​P​368  ​L​​R​​K​​Y​​F​​N​​D​​K​​I​​H​378  ​A​​K​​A​​D​​H​​W​​D​​E​​Q​​K​388  ​F​​T​​E​​T​​Y​​C​​H​​W​​I​​L​398  ​G​​E​​W​​R​​V​​G​​V​​K​​D​​Q​408  ​D​​K​​K​​D​​G​​A​​K​​Y​​S​​Y​418  ​K​​D​​L​​C​​N​​E​​L​​K​​Q​​K​428  ​V​​T​​K​​A​​G​​L​​V​​D​​F​​L​438  ​L​​E​​L​​D​​P​​C​​R​​T​​I​​P​448  ​P​​Y​​L​​D​​N​​N​​N​​R​​K​​P​458  ​P​​K​​C​​Q​​S​​L​​I​​L​​N​​P​468  ​K​​F​​L​​D​​N​​Q​​Y​​P​​N​​W​478  ​Q​​Q​​Y​​L​​Q​​E​​L​​K​​K​​L​488  ​Q​​S​​I​​Q​​N​​Y​​L​​D​​S​​F​498  ​E​​T​​D​​L​​K​​V​​L​​K​​S​​S​508  ​K​​D​​Q​​P​​Y​​F​​V​​E​​Y​​K​518  ​S​​S​​N​​Q​​Q​​I​​A​​S​​G​​Q​528  ​R​​D​​Y​​K​​D​​L​​D​​A​​R​​I​538  ​L​​Q​​F​​I​​F​​D​​R​​V​​K​​A​548  ​S​​D​​E​​L​​L​​L​​N​​E​​I​​Y​558  ​F​​Q​​A​​K​​K​​L​​K​​Q​​K​​A​     ​S​​S​​E​​L​​E​​K​​L​​E​​S​​S​578  ​K​​K​​L​​D​​E​​V​​I​​A​​N​​S​588  ​Q​​L​​S​​Q​​I​​L​​K​​S​​Q​​H​598  ​T​​N​​G​​I​​F​​E​​Q​​G​​T​​F​608  ​L​​H​​L​​V​​C​​K​​Y​​Y​​K​​Q​618  ​R​​Q​​R​​A​​R​​D​​S​​R​​L​​Y​628  ​I​​M​​P​​E​​Y​​R​​Y​​D​​K​​K​638  ​L​​H​​K​​Y​​N​​N​​T​​G​​R​​F​648  ​D​​D​​D​​N​​Q​​L​​L​​T​​Y​​C​658  ​N​​H​​K​​P​​R​​Q​​K​​R​​Y​​Q​668  ​L​​L​​N​​D​​L​​A​​G​​V​​L​​Q​678  ​V​​S​​P​​N​​F​​L​​K​​D​​K​​I​688  ​G​​S​​D​​D​​D​​L​​F​​I​​S​​K​698  ​W​​L​​V​​E​​H​​I​​R​​G​​F​​K​708  ​K​​A​​C​​E​​D​​S​​L​​K​​I​​Q​718  ​K​​D​​N​​R​​G​​L​​L​​N​​H​​K​728  ​I​​N​​I​​A​​R​​N​​T​​K​​G​​K​738  ​C​​E​​K​​E​​I​​F​​N​​L​​I​​C​748  ​K​​I​​E​​G​​S​​E​​D​​K​​K​​G​     ​N​​Y​​K​​H​​G​​L​​A​​Y​​E​​L​768  ​G​​V​​L​​L​​F​​G​​E​​P​​N​​E​778  ​A​​S​​K​​P​​E​​F​​D​​R​​K​​I​788  ​K​​K​​F​​N​​S​​I​​Y​​S​​F​​A​798  ​Q​​I​​Q​​Q​​I​​A​​F​​A​​E​​R​808  ​K​​G​​N​​A​​N​​T​​C​​A​​V​​C​818  ​S​​A​​D​​N​​A​​H​​R​​M​​Q​​Q​828  ​I​​K​​I​​T​​E​​P​​V​​E​​D​​N​     ​K​​D​​K​​I​​I​​L​​S​​A​​K​​A​848  ​Q​​R​​L​​P​​A​​I​​P​​T​​R​​I​858  ​V​​D​​G​​A​​V​​K​​K​​M​​A​​T​868  ​I​​L​​A​​K​​N​​I​​V​​D​​D​​N​878  ​W​​Q​​N​​I​​K​​Q​​V​​L​​S​​A​888  ​K​​H​​Q​​L​​H​​I​​P​​I​​I​​T​898  ​E​​S​​N​​A​​F​​E​​F​​E​​P​​A​908  ​L​​A​​D​​V​​K​​G​​K​​S​​L​​K​918  ​D​​R​​R​​K​​K​​A​​L​​E​​R​​I​928  ​S​​P​​E​​N​​I​​F​​K​​D​​K​​N​938  ​N​​R​​I​​K​​E​​F​​A​​K​​G​​I​     ​S​​A​​Y​​S​​G​​A​​N​​L​​T​​D​     ​G​​D​​F​​D​​G​​A​​K​​E​​E​​L​968  ​D​​H​​I​​I​​P​​R​​S​​H​​K​​K​     ​Y​​G​​T​​L​​N​​D​​E​​A​​N​​L​988  ​I​​C​​V​​T​​R​​G​​D​​A​​K​​N​     ​K​​G​​N​​R​​I​​F​​C​​L​​R​​D​     ​L​​A​​D​​N​​Y​​K​​L​​K​​Q​​F​     ​E​​T​​T​​D​​D​​L​​E​​I​​E​​K​     ​K​​I​​A​​D​​T​​I​​W​​D​​A​​N​     ​K​​K​​D​​F​​K​​F​​G​​N​​Y​​R​1048 ​S​​F​​I​​N​​L​​T​​P​​Q​​E​​Q​1058 ​K​​A​​F​​R​​H​​A​​L​​F​​L​​A​1068 ​D​​E​​N​​P​​I​​K​​Q​​A​​V​​I​1078 ​R​​A​​I​​N​​N​​R​​N​​R​​T​​F​1088 ​V​​N​​G​​T​​Q​​R​​Y​​F​​A​​E​1098 ​V​​L​​A​​N​​N​​I​​Y​​L​​R​​A​1108 ​K​​K​​E​​N​​L​​N​​T​​D​​K​​I​1118 ​S​​F​​D​​Y​​F​​G​​I​​P​​T​​I​1128 ​G​​N​​G​​R​​G​​I​​A​​E​​I​​R​1138 ​Q​​L​​Y​​E​​K​​V​​D​​S​​D​​I​1148 ​Q​​A​​Y​​A​​K​​G​​D​​K​​P​​Q​1158 ​A​​S​​Y​​S​​H​​L​​I​​D​​A​​M​1168 ​L​​A​​F​​C​​I​​A​​A​​D​​E​​H​1178 ​R​​N​​D​​G​​S​​I​​G​​L​​E​​I​1188 ​D​​K​​N​​Y​​S​​L​​Y​​P​​L​​D​     ​K​​N​​T​​G​​E​​V​​F​​T​​K​​D​1208 ​I​​F​​S​​Q​​I​​K​​I​​T​​D​​N​1218 ​E​​F​​S​​D​​K​​K​​L​​V​​R​​K​1228 ​K​​A​​I​​E​​G​​F​​N​​T​​H​​R​1238 ​Q​​M​​T​​R​​D​​G​​I​​Y​​A​​E​1248 ​N​​Y​​L​​P​​I​​L​​I​​H​​K​​E​1258 ​L​​N​​E​​V​​R​​K​​G​​Y​​T​​W​1268 ​K​​N​​S​​E​​E​​I​​K​​I​​F​​K​1278 ​G​​K​​K​​Y​​D​​I​​Q​​Q​​L​​N​1288 ​N​​L​​V​​Y​​C​​L​​K​​F​​V​​D​1298 ​K​​P​​I​​S​​I​​D​​I​​Q​​I​​S​1308 ​T​​L​​E​​E​​L​​R​​N​​I​​L​​T​1318 ​T​​N​​N​​I​​A​​A​​T​​A​​E​​Y​1328 ​Y​​Y​​I​​N​​L​​K​​T​​Q​​K​​L​1338 ​H​​E​​Y​​Y​​I​​E​​N​​Y​​N​​T​1348 ​A​​L​​G​​Y​​K​​K​​Y​​S​​K​​E​1358 ​M​​E​​F​​L​​R​​S​​L​​A​​Y​​R​1368 ​S​​E​​R​​V​​K​​I​​K​​S​​I​​D​1378 ​D​​V​​K​​Q​​V​​L​​D​​K​​D​​S​1388 ​N​​F​​I​​I​​G​​K​​I​​T​​L​​P​1398 ​F​​K​​K​​E​​W​​Q​​R​​L​​Y​​R​1408 ​E​​W​​Q​​N​​T​​T​​I​​K​​D​​D​1418 ​Y​​E​​F​​L​​K​​S​​F​​F​​N​​V​1428 ​K​​S​​I​​T​​K​​L​​H​​K​​K​​V​1438 ​R​​K​​D​​F​​S​​L​​P​​I​​S​​T​1448 ​N​​E​​G​​K​​F​​L​​V​​K​​R​​K​1458 ​T​​W​​D​​N​​N​​F​​I​​Y​​Q​​I​1468 ​L​​N​​D​​S​​D​​S​​R​​A​​D​​G​1478 ​T​​K​​P​​F​​I​​P​​A​​F​​D​​I​1488 ​S​​K​​N​​E​​I​​V​​E​​A​​I​​I​1498 ​D​​S​​F​​T​​S​​K​​N​​I​​F​​W​1508 ​L​​P​​K​​N​​I​​E​​L​​Q​​K​​V​1518 ​D​​N​​K​​N​​I​​F​​A​​I​​D​​T​1528 ​S​​K​​W​​F​​E​​V​​E​​T​​P​​S​1538 ​D​​L​​R​​D​​I​​G​​I​​A​​T​​I​1548 ​Q​​Y​​K​​I​​D​​N​​N​​S​​R​​P​1558 ​K​​V​​R​​V​​K​​L​​D​​Y​​V​​I​1568 ​D​​D​​D​​S​​K​​I​​N​​Y​​F​​M​1578 ​N​​H​​S​​L​​L​​K​​S​​R​​Y​​P​1588 ​D​​K​​V​​L​​E​​I​​L​​K​​Q​​S​1598 ​T​​I​​I​​E​​F​​E​​S​​S​​G​​F​1608 ​N​​K​​T​​I​​K​​E​​M​​L​​G​​M​1618 ​K​​L​​A​​G​​I​​Y​​N​​E​​T​​S​     ​N​​N​
Type
Asm Id
Dynamic Bonds

Select a different viewer

Citation:

See Citation Policies for referencing Mol*, RCSB PDB, PDB structures, and Computed Structure Models.